बलिया सरकार स्वास्थ्य प्रणालियों के संबंध में सभी प्रयास कर रही है । एलोपैथिक , आयुर्वेदिक और होम्योपैथिक अस्पतालों के बुनियादी ढांचे को मजबूत करने के प्रयास किए जा रहे हैं । जिले में स्थित होम्योपैथिक क्लीनिकों से कुल छियासठ सरकारी होम्योपैथिक क्लीनिक संचालित हो रहे हैं । इन क्लीनिकों में पचास डॉक्टर तैनात हैं । सत्रह चिकित्सालय चल रहे हैं । वहाँ कोई डॉक्टर नहीं हैं । हाल ही में , ये सत्रह क्लीनिक संलग्न डॉक्टरों द्वारा चलाए जा रहे हैं ।