राष्ट्रीय एड्स नियंत्रण बोर्ड की अध्यक्षता स्वास्थ्य एवं परिवार कल्याण मंत्रालय के स्वास्थ्य सचिव करते हैं इसका कार्य कृति प्रबंधन अनुमोदन तथा निजी एजेंसियों को संविदा देना है उनके कार्य को शीघ्र निपटाने के लिए राष्ट्रीय एड्स नियंत्रण संगठन की नीतियों का पुनरीक्षण करना शामिल है बोर्ड के अन्य प्रमुख कार्यों में वार्षिक संचालन योजना बजट का निर्माण करना कार्यक्रम घटकों के बीच दीदी का पुणे आवंटन करना कार्यक्रम प्रबंधकीय दलों का निर्माण करना और वरिष्ठ कार्यक्रम स्टाफ की नियुक्ति करना जैसे काम शामिल है